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ChalkTalk@ZIRC No.104——核酸智能化超并行分析技术【主讲嘉宾:宋萍】

2026-05-22 12:00-13:30 致远学院(光彪楼)110教室

主讲嘉宾

宋萍,上海交通大学生物医学工程学院副教授

主讲内容

核酸变异分析是解析基因功能、研究疾病机制及实现精准医学的关键手段,在肿瘤早期诊断、术后监测和个性化用药中作用显著。但当前技术面临通量低、灵敏度不足、多靶点协同检测困难等瓶颈,尤其在液体活检中痕量低丰度变异检测极具挑战。本研究聚焦高通量核酸智能化超并行分析技术。通过提出“核酶热动”核酸分子探针杂交扩增模型,结合热力学碱基堆积智能计算,构建了精准预测杂交扩增的新模型。据此智能化设计高通量探针,实现了十万级单管超并行扩增,通量较常规方法提升1000倍,并建立了针对低频点突变、融合基因、缺失和嵌入等突变类型的高灵敏检测体系。利用该技术鉴定出42个宫颈癌新型融合基因标志物,初步验证其促肿瘤机制及药物敏感性。进一步开发了痕量低频突变的高通量检测方法,仅用单重探针即可检测87个突变,检测限降低10倍,时间缩短4倍,成本减少50倍。该方法已成功应用于结直肠癌、肝癌等肿瘤的精准分型及个性化用药指导,相关技术已实现临床转化并用于分子诊断,为肿瘤精准诊疗提供了重要工具。

科学问题

1.如果未来我们能在一次血液检测中同时监测体内所有基因的变异动态,你认为这会给疾病预防、早期诊断和治疗带来哪些颠覆性变化?又会引发哪些新的医学或伦理挑战?

2.高通量、超灵敏的核酸分析产生了海量的基因组变异数据。如何从这些数据中区分“驱动变异”与“乘客变异”?你认为传统统计学或人工智能在解决这一问题上各自有何优势和局限?

3.核酸分析技术的快速发展在很大程度上依赖于化学、物理、计算机科学等多学科的交叉融合。如果让你设计一个跨学科的研究项目,针对当前技术仍未解决的瓶颈(例如如何实现真正的实时、无创、连续监测),你会如何整合不同领域的知识?

活动时间

2026年5月22日(周五)12:00—13:30

活动地点

致远学院(光彪楼)110教室

形式

小班座谈(15人左右),提供午餐

报名方式

有兴趣参加本期ChalkTalk的同学请点击下方链接报名:https://www.wjx.top/vm/YSuEsea.aspx#

报名截止时间:2026年5月18日(周一)上午9时。中心将从所有报名者中遴选15位左右思考深入的同学参加本次活动。报名成功者将于5月18日下午5时前收到由中心发出的短信或邮件确认通知。

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